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要关闭拼多多商家的短信自动充值功能，可以按照以下步骤操作。
1、登录拼多多商家后台：使用商家账号登录拼多多商家后台。
2、进入账户中心：在后台首页，找到账户资金或账户管理等相关选项，点击进入账户中心。
3、找到自动充值设置：在账户中心页面，找到与短信自动充值相关的设置选项。
4、取消自动充值：点击取消或关闭与短信自动充值相关的功能。
5、确认关闭：操作后，系统会提示是否确认关闭该功能，请确认选择。
具体的操作步骤可能因拼多多平台的更新而略有变化，如果遇到操作问题，建议联系拼多多客服进行咨询，以确保准确关闭短信自动充值功能。